Klinika mieści się w specjalnie zaprojektowanym dla jej potrzeb budynku. Skonstruowano go według obowiązujących standardów wymaganych przy wysoko specjalistycznym leczeniu ciężko chorych dzieci i ku poprawie warunków sprawowania nad nimi opieki lekarzy i rodziców. Projektanci, dzięki współpracy z utalentowanymi studentami Pracowni Malarstwa Akademii Sztuk Pięknych w Gdańsku stworzyli we wnętrzach niepowtarzalny barwny świat baśni, sprzyjający leczeniu i odzyskiwaniu sił przez małych pacjentów w myśl słów Pani Jolanty Kwaśniewskiej "w kolorze mniej boli".
W Klinice znajduje się 37 łóżek, ambulatoria, pracownie: hematologiczna, mikroskopowa, diagnostyki ultrasonograficznej i gabinet EKG. Obszerne hole i świetlice wyposażone są w szafki szkolne i komputery, a także miejsca noclegowe dla rodziców. Możliwości swobodnego poruszania się po Klinice oraz korzystania z podręcznej kuchni stwarzają dzieciom namiastkę atmosfery domu i uatrakcyjniają czas wolny spędzany w szpitalu.
Budowę Kliniki największymi kwotami wsparli tzw. "Złoci Sponsorzy": Polpharma S.A., Polkomtel S.A., Petrobaltic Sp. z o.o., PKN Orlen S.A., Prokom Software S.A, Fundacja "Warta", Telekomunikacja Polska S.A i PKO BP S.A. Dotacja Ministra Zdrowia przyznana Akademii Medycznej w Gdańsku wyniosła 1.411.000 zł. Akademia Medyczna ze środków własnych sfinansowała wykonanie infrastruktury technicznej terenu na kwotę 300.000,00 zł.
